武漢肺炎打擊全球生產活動，多種產品供應受影響。中國生產大量汽車零件、玩具、電子產品，也生產藥物及醫療物資，但中國工廠停工，導致原材料或中間產品未能出口，繼而影響其他國家的生產進度。專家認為，武漢肺炎反映出中國的供應鏈牽連甚廣，其他國家或企業都意識到有逼切需要分散風險，甚至嘗試把供應鏈本地化，尤其是科技或藥物等戰略物資，所以疫情過後，全球的供應鏈將出現改變。然而，各行業要在短期內分散風險並非易事。以製衣業為例，雖然不少企業轉移到孟加拉、越南等國設廠，但仍需依賴中國供應原材料或技術。
新加坡國立大學商學院高級客席研究員卡普里（Alex Capri）指出：「武漢肺炎疫情其中最顯而易見的現象，是中國自2003年沙士疫情後至今建立的價值鏈，出現了快速改變的群聚效應。」卡普里提到，現時很多企業開始本地化他們的供應鏈，尤其是科技及藥物等戰略物資，加上受中美貿易戰影響，企業已開始將其供應鏈分散到中國以外地區，而經過今次相信更會加快速度。「我們會見到供應鏈大規模重組」。
德國供應鏈諮詢公司「Kloepfel Consulting」二月的調查顯示，全球1/3公司都有大型的中國顧客，81%公司依賴中國的供應商。卡普里認為，即使全球供應鏈大規模重組，中國仍會在供應及銷售市場有重要角色，企業意識到有逼切的需要，去實現供應鏈多元化及可持續發展。「我不認為會回復至過去數十年以來的模樣，我們身處完全不同的年代，我們過去認識的全球化已經完結」。
世界銀行數據顯示，中國在2009年成為全球最大出口國，2018年的貿易量佔全球1/3。中國佔美國近1/4進口商品，包括幾乎全部聖誕裝飾。全球的製造商都依賴中國工廠生產很多中間產品，例如汽車及電子產品零件等。法國巴黎銀行（BNP
Paribas）大中華區高級經濟學家羅念慈指出：「全球越來越依賴中國生產中間產品，世界各地的公司難以避免生產及供應受阻。」
製衣業是其中一個成功搬離中國的行業，不少企業為求廉價勞動力，把生產線轉移到孟加拉等國，孟加拉是全球最大服裝出口國之一，僅次於中國。根據世界貿易組織的數字，中國佔全球服裝出口的份額，由2010年的37%下降至2018年的31%。然而，中國同期的原材料出口由30%增至38%，反映中國仍掌握大量服裝原材料，在中國設廠仍有一定吸引力。中國出產的服裝原材料會運到越南、巴基斯坦及孟加拉等國作進一步生產，這些新興生產國家，目前仍要依賴中國出口如拉鍊等工序較複雜的配件。由於廠商一般很難預計買家需要甚麼風格的服裝，所以工廠很難事先積存原材料。孟加拉及越南已嘗試增加服裝原材料生產，但並非短期內做到。
在汽車生產方面，湖北設有多間汽車品牌的車廠。快意佳士拿（Fiat Chrysler）二月表示，由於無法從中國購入零件，所以塞爾維亞的汽車生產要暫停；通用汽車的工會警告，由於來自中國的零件減少，有機會影響生產；南韓現代汽車（Hyundai）由於無法獲得來自中國的零件，需要暫停蔚山的一條重要組裝線。至於電子產品，日本遊戲機生產商任天堂去年把旗下遊戲機「Switch」的生產線轉移到越南，但任天堂表示，受武漢肺炎疫情影響，中國生產零件速度減慢，導致遊戲機產量受到影響。
武漢肺炎令全國重新反思對中國藥物及醫療用品的依賴，中國出口大量製藥原料「活性藥物成份」（active
pharmaceutical ingredients，APIs），也有醫學口罩和醫療裝備。美國雖然是領先全球的藥物研發國家，但大部份藥物生產都已經轉移到海外。美國外交關係委員會全球健康高級研究員黃嚴忠指出，近年中國藥廠供應美國超過90%的抗生素、維他命C、布洛芬（Ibuprofen）、氫化可體松（Hydrocortisone）、70%的撲熱息痛（Acetaminophen）及40至45%的肝素。
有評論認為，武漢肺炎疫情展現美國在這方面長期依賴中國的缺點，一旦發生戰爭、貿易衝突或流行病，美國人就會面臨嚴重藥物短缺。黑斯廷斯中心（Hastings Center）高級顧問吉遜（Rosemary Gibson）說：「如果中國停止向我國出口生產藥物的核心材料，數個月內，我們藥物的貨架將空空如也，醫療系統無法運作。每當發生天災或全球流行病，美國將和其他所有國家一樣，排隊等待獲得最基本的藥物。」
